ความแตกต่างเบื้องต้นระหว่างสัญญาแฟรนไชส์และสัญญาอนุญาตให้ใช้สิทธิใน商標
โดยหลักแล้วสัญญาแฟรนไซส์จะมีข้อกำหนดเกี่ยวกับการดำเนินการในด้านธุรกิจเป็นสำคัญ โดยแฟรนไซส์ซีจะต้องดำเนินธุรกิจให้เป็นไปตามข้อกำหนดในสัญญาซึ่งได้ทำระหว่างแฟรนไชส์ชอร์และแฟรนไชส์ชี โดยส่วนใหญ่จะเป็นข้อตกลงการใช้ผลิตภัณฑ์ ข้อตกลงการซื้อขายสูตร หรือข้อตกลงซึ่งกำหนดให้ใช้วัตถุดิบของแฟรนไชส์ชอร์เท่านั้น
แต่กรณีของสัญญาอนุญาตให้ใช้商標นั้น ผู้ได้รับอนุญาตให้ใช้商標จะต้องปฎิบัติตามเงื่อนไขหรือข้อกำหนดที่เพื่อการควบคุมคุณภาพสินค้าหรือบริการ ตามที่เจ้าของ商標กำหนดโดยเน้นหนักไปทางด้านคุณภาพสินค้าและการบริการเป็นสำคัญซึ่งเจ้าของเครื่องหมายจะเป็นผู้ควบคุมดูแลการผลิตโดยตรงเนื่องจากจะต้องควบคุมมาตรฐานให้เป็นไปในทิศทางเดียวกัน